Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
WDR53Q7Z5U6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
WDR53Q7Z5U6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms