Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD20A3Q5VUR7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD20A3Q5VUR7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD20A3Q5VUR7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD20A3Q5VUR7 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ANKRD20A3Q5VUR7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ANKRD20A3Q5VUR7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms