Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
BHMG1C9JSJ3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BHMG1C9JSJ3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms