Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 325.9 ms