Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
INPP4AQ96PE3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms