Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC82Q8N4S0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC82Q8N4S0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms