Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
WDR88Q6ZMY6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
WDR88Q6ZMY6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms