Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
HIF1AQ16665 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HIF1AQ16665 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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