Protein–RNA interactions for Protein: Q05C16

LRRC63, Leucine-rich repeat-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC63Q05C16 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRRC63Q05C16 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRRC63Q05C16 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.2 ms