Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSO14618 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSO14618 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSO14618 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSO14618 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSO14618 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSO14618 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSO14618 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSO14618 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSO14618 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSO14618 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSO14618 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSO14618 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSO14618 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSO14618 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCSO14618 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCSO14618 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCSO14618 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CCSO14618 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCSO14618 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCSO14618 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCSO14618 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCSO14618 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
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