Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATP8A1Q9Y2Q0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms