Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SPRYD3Q8NCJ5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SPRYD3Q8NCJ5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms