Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
EEA1Q15075 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
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EEA1Q15075 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
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EEA1Q15075 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
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EEA1Q15075 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
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EEA1Q15075 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
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EEA1Q15075 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
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EEA1Q15075 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
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EEA1Q15075 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
EEA1Q15075 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
EEA1Q15075 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
EEA1Q15075 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
EEA1Q15075 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
EEA1Q15075 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
EEA1Q15075 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
EEA1Q15075 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
EEA1Q15075 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
EEA1Q15075 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
EEA1Q15075 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
EEA1Q15075 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
EEA1Q15075 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
EEA1Q15075 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
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