Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ARFGEF2Q9Y6D5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARFGEF2Q9Y6D5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms