Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CRIP3Q6Q6R5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CRIP3Q6Q6R5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.5 ms