Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TRMT12Q53H54 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms