Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HIF1AQ16665 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HIF1AQ16665 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms