Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LINC00205P59089 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC00205P59089 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms