Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.42■■■■■ 4.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC44.4■■■■■ 4.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC44.39■■■■■ 4.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.38■■■■■ 4.7
BIVM-ERCC5R4GMW8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC44.36■■■■■ 4.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC44.34■■■■■ 4.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.33■■■■■ 4.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC44.32■■■■■ 4.69
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC44.31■■■■■ 4.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC44.31■■■■■ 4.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC44.29■■■■■ 4.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.27■■■■■ 4.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC44.24■■■■■ 4.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC44.23■■■■■ 4.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC44.22■■■■■ 4.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC44.2■■■■■ 4.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC44.2■■■■■ 4.67
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC44.19■■■■■ 4.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC44.17■■■■■ 4.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC44.17■■■■■ 4.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.16■■■■■ 4.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC44.14■■■■■ 4.66
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC44.07■■■■■ 4.65
BIVM-ERCC5R4GMW8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC44.07■■■■■ 4.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC44.04■■■■■ 4.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC44.04■■■■■ 4.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
BIVM-ERCC5R4GMW8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.95■■■■■ 4.63
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC43.92■■■■■ 4.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
BIVM-ERCC5R4GMW8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.84■■■■■ 4.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC43.84■■■■■ 4.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC43.84■■■■■ 4.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.82■■■■■ 4.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms