Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACKR4Q9NPB9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACKR4Q9NPB9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ACKR4Q9NPB9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACKR4Q9NPB9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACKR4Q9NPB9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACKR4Q9NPB9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACKR4Q9NPB9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACKR4Q9NPB9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ACKR4Q9NPB9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACKR4Q9NPB9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACKR4Q9NPB9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ACKR4Q9NPB9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ACKR4Q9NPB9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACKR4Q9NPB9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACKR4Q9NPB9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ACKR4Q9NPB9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACKR4Q9NPB9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ACKR4Q9NPB9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACKR4Q9NPB9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ACKR4Q9NPB9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACKR4Q9NPB9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACKR4Q9NPB9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACKR4Q9NPB9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ACKR4Q9NPB9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ACKR4Q9NPB9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ACKR4Q9NPB9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACKR4Q9NPB9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACKR4Q9NPB9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACKR4Q9NPB9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ACKR4Q9NPB9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACKR4Q9NPB9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACKR4Q9NPB9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACKR4Q9NPB9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACKR4Q9NPB9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACKR4Q9NPB9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACKR4Q9NPB9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms