Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PCGF6Q9BYE7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
PCGF6Q9BYE7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
PCGF6Q9BYE7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
PCGF6Q9BYE7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
PCGF6Q9BYE7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
PCGF6Q9BYE7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
PCGF6Q9BYE7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
PCGF6Q9BYE7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
PCGF6Q9BYE7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC40.13■■■■■ 4.01
PCGF6Q9BYE7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
PCGF6Q9BYE7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC40.12■■■■■ 4.01
PCGF6Q9BYE7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PCGF6Q9BYE7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
PCGF6Q9BYE7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
PCGF6Q9BYE7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PCGF6Q9BYE7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
PCGF6Q9BYE7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
PCGF6Q9BYE7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
PCGF6Q9BYE7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PCGF6Q9BYE7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC40.08■■■■■ 4.01
PCGF6Q9BYE7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
PCGF6Q9BYE7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
PCGF6Q9BYE7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
PCGF6Q9BYE7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
PCGF6Q9BYE7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC40.06■■■■■ 4
PCGF6Q9BYE7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC40.06■■■■■ 4
PCGF6Q9BYE7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
PCGF6Q9BYE7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
PCGF6Q9BYE7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC40.05■■■■■ 4
PCGF6Q9BYE7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC40.04■■■■■ 4
PCGF6Q9BYE7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
PCGF6Q9BYE7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
PCGF6Q9BYE7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
PCGF6Q9BYE7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
PCGF6Q9BYE7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
PCGF6Q9BYE7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
PCGF6Q9BYE7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
PCGF6Q9BYE7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
PCGF6Q9BYE7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PCGF6Q9BYE7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
PCGF6Q9BYE7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
PCGF6Q9BYE7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
PCGF6Q9BYE7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
PCGF6Q9BYE7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC39.94■■■■□ 3.98
PCGF6Q9BYE7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
PCGF6Q9BYE7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
PCGF6Q9BYE7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
PCGF6Q9BYE7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
PCGF6Q9BYE7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
PCGF6Q9BYE7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
PCGF6Q9BYE7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
PCGF6Q9BYE7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
PCGF6Q9BYE7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
PCGF6Q9BYE7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
PCGF6Q9BYE7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
PCGF6Q9BYE7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
PCGF6Q9BYE7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
PCGF6Q9BYE7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
PCGF6Q9BYE7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC39.84■■■■□ 3.97
PCGF6Q9BYE7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
PCGF6Q9BYE7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
PCGF6Q9BYE7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PCGF6Q9BYE7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
PCGF6Q9BYE7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
PCGF6Q9BYE7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
PCGF6Q9BYE7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
PCGF6Q9BYE7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.97
PCGF6Q9BYE7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
PCGF6Q9BYE7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
PCGF6Q9BYE7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
PCGF6Q9BYE7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
PCGF6Q9BYE7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
PCGF6Q9BYE7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC39.8■■■■□ 3.96
PCGF6Q9BYE7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
PCGF6Q9BYE7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
PCGF6Q9BYE7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
PCGF6Q9BYE7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
PCGF6Q9BYE7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
PCGF6Q9BYE7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC39.77■■■■□ 3.96
PCGF6Q9BYE7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
PCGF6Q9BYE7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
PCGF6Q9BYE7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
PCGF6Q9BYE7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC39.76■■■■□ 3.96
PCGF6Q9BYE7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
PCGF6Q9BYE7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
PCGF6Q9BYE7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC39.74■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.72■■■■□ 3.95
PCGF6Q9BYE7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms