Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC106Q9BWC9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CCDC106Q9BWC9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC106Q9BWC9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC106Q9BWC9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC106Q9BWC9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC106Q9BWC9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC106Q9BWC9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC106Q9BWC9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC106Q9BWC9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC106Q9BWC9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC106Q9BWC9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC106Q9BWC9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC106Q9BWC9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC106Q9BWC9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC106Q9BWC9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC106Q9BWC9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC106Q9BWC9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC106Q9BWC9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC106Q9BWC9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC106Q9BWC9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC106Q9BWC9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC106Q9BWC9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms