Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM2Q9BVW6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM2Q9BVW6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SMIM2Q9BVW6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SMIM2Q9BVW6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms