Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms