Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NDFIP1Q9BT67 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
NDFIP1Q9BT67 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
NDFIP1Q9BT67 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
NDFIP1Q9BT67 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms