Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CCDC77Q9BR77 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
CCDC77Q9BR77 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC77Q9BR77 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC77Q9BR77 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC77Q9BR77 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CCDC77Q9BR77 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CCDC77Q9BR77 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC77Q9BR77 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC77Q9BR77 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC77Q9BR77 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC77Q9BR77 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC77Q9BR77 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC77Q9BR77 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC77Q9BR77 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC77Q9BR77 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC77Q9BR77 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC77Q9BR77 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC77Q9BR77 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC77Q9BR77 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC77Q9BR77 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC77Q9BR77 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC77Q9BR77 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC77Q9BR77 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC77Q9BR77 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC77Q9BR77 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC77Q9BR77 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC77Q9BR77 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC77Q9BR77 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC77Q9BR77 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC77Q9BR77 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC77Q9BR77 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC77Q9BR77 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC77Q9BR77 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC77Q9BR77 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC77Q9BR77 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC77Q9BR77 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC77Q9BR77 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC77Q9BR77 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC77Q9BR77 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC77Q9BR77 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC77Q9BR77 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC77Q9BR77 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms