Protein–RNA interactions for Protein: Q99946

PRRT1, Proline-rich transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1Q99946 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PRRT1Q99946 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRRT1Q99946 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PRRT1Q99946 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PRRT1Q99946 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRRT1Q99946 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms