Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GBP4Q96PP9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GBP4Q96PP9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
GBP4Q96PP9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GBP4Q96PP9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GBP4Q96PP9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
GBP4Q96PP9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
GBP4Q96PP9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GBP4Q96PP9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GBP4Q96PP9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GBP4Q96PP9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GBP4Q96PP9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GBP4Q96PP9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GBP4Q96PP9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GBP4Q96PP9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GBP4Q96PP9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
GBP4Q96PP9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GBP4Q96PP9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GBP4Q96PP9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
GBP4Q96PP9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GBP4Q96PP9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GBP4Q96PP9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GBP4Q96PP9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GBP4Q96PP9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
GBP4Q96PP9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GBP4Q96PP9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
GBP4Q96PP9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
GBP4Q96PP9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GBP4Q96PP9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
GBP4Q96PP9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GBP4Q96PP9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
GBP4Q96PP9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
GBP4Q96PP9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
GBP4Q96PP9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GBP4Q96PP9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
GBP4Q96PP9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GBP4Q96PP9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GBP4Q96PP9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GBP4Q96PP9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GBP4Q96PP9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
GBP4Q96PP9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GBP4Q96PP9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GBP4Q96PP9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
GBP4Q96PP9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GBP4Q96PP9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
GBP4Q96PP9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
GBP4Q96PP9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GBP4Q96PP9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GBP4Q96PP9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GBP4Q96PP9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GBP4Q96PP9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GBP4Q96PP9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GBP4Q96PP9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GBP4Q96PP9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
GBP4Q96PP9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GBP4Q96PP9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
GBP4Q96PP9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GBP4Q96PP9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GBP4Q96PP9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GBP4Q96PP9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GBP4Q96PP9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GBP4Q96PP9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
GBP4Q96PP9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GBP4Q96PP9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
GBP4Q96PP9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GBP4Q96PP9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
GBP4Q96PP9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GBP4Q96PP9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
GBP4Q96PP9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GBP4Q96PP9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GBP4Q96PP9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
GBP4Q96PP9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GBP4Q96PP9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GBP4Q96PP9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
GBP4Q96PP9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms