Protein–RNA interactions for Protein: Q96PI1

SPRR4, Small proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR4Q96PI1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SPRR4Q96PI1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPRR4Q96PI1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SPRR4Q96PI1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPRR4Q96PI1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPRR4Q96PI1 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPRR4Q96PI1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPRR4Q96PI1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SPRR4Q96PI1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPRR4Q96PI1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPRR4Q96PI1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SPRR4Q96PI1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms