Protein–RNA interactions for Protein: Q96NR8

RDH12, Retinol dehydrogenase 12, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH12Q96NR8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RDH12Q96NR8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RDH12Q96NR8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RDH12Q96NR8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDH12Q96NR8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RDH12Q96NR8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RDH12Q96NR8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RDH12Q96NR8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RDH12Q96NR8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RDH12Q96NR8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RDH12Q96NR8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RDH12Q96NR8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RDH12Q96NR8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RDH12Q96NR8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RDH12Q96NR8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RDH12Q96NR8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RDH12Q96NR8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RDH12Q96NR8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RDH12Q96NR8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RDH12Q96NR8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RDH12Q96NR8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RDH12Q96NR8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RDH12Q96NR8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RDH12Q96NR8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RDH12Q96NR8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RDH12Q96NR8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RDH12Q96NR8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RDH12Q96NR8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RDH12Q96NR8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RDH12Q96NR8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RDH12Q96NR8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RDH12Q96NR8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RDH12Q96NR8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RDH12Q96NR8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RDH12Q96NR8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RDH12Q96NR8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDH12Q96NR8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RDH12Q96NR8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RDH12Q96NR8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RDH12Q96NR8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RDH12Q96NR8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RDH12Q96NR8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RDH12Q96NR8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RDH12Q96NR8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDH12Q96NR8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDH12Q96NR8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDH12Q96NR8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDH12Q96NR8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDH12Q96NR8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RDH12Q96NR8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RDH12Q96NR8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RDH12Q96NR8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RDH12Q96NR8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RDH12Q96NR8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RDH12Q96NR8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms