Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
C8orf49Q96NF6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C8orf49Q96NF6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C8orf49Q96NF6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C8orf49Q96NF6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
C8orf49Q96NF6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
C8orf49Q96NF6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C8orf49Q96NF6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C8orf49Q96NF6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C8orf49Q96NF6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C8orf49Q96NF6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C8orf49Q96NF6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C8orf49Q96NF6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
C8orf49Q96NF6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C8orf49Q96NF6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
C8orf49Q96NF6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
C8orf49Q96NF6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
C8orf49Q96NF6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
C8orf49Q96NF6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
C8orf49Q96NF6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
C8orf49Q96NF6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
C8orf49Q96NF6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms