Protein–RNA interactions for Protein: Q96I24

FUBP3, Far upstream element-binding protein 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUBP3Q96I24 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.444e-7■■■■■ 32.1
FUBP3Q96I24 GTF2A1-203ENST00000553612 6306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.133e-7■■■■■ 31.9
FUBP3Q96I24 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.385e-7■■■■■ 31.9
FUBP3Q96I24 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.15e-7■■■■■ 31.9
FUBP3Q96I24 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 31.8
FUBP3Q96I24 FOSL2-202ENST00000379619 5829 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 31.8
FUBP3Q96I24 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.561e-6■■■■■ 31.8
FUBP3Q96I24 MAML2-201ENST00000524717 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.591e-6■■■■■ 31.7
FUBP3Q96I24 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.069e-12■■■■■ 31.6
FUBP3Q96I24 TGFA-201ENST00000295400 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.585e-7■■■■■ 31.5
FUBP3Q96I24 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.497e-9■■■■■ 31.4
FUBP3Q96I24 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.17e-9■■■■■ 31.4
FUBP3Q96I24 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 31.4
FUBP3Q96I24 TACC1-201ENST00000276520 6513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 31.4
FUBP3Q96I24 TACC1-206ENST00000519093 6447 ntTSL 1 (best)7.71□□□□□ -1.182e-7■■■■■ 31.4
FUBP3Q96I24 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.491e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.41e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.91e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.721e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.541e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.261e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 TMEM64-202ENST00000422900 1174 ntTSL 216.32■□□□□ 0.21e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 CHFR-214ENST00000536932 584 ntTSL 416.15■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 ZNF605-201ENST00000331711 838 ntTSL 215.93■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 NDRG1-216ENST00000521026 2145 ntTSL 214.23□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.191e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 WWC2-208ENST00000508747 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 NDRG1-217ENST00000521414 2349 ntTSL 213.79□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 WWC2-209ENST00000513834 4887 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.311e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 NDRG1-204ENST00000517599 2918 ntTSL 212.18□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 PNPLA8-208ENST00000453144 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 WWC2-204ENST00000448232 6356 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 WWC2-205ENST00000504005 5247 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.571e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 PNPLA8-206ENST00000436062 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.611e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 NDRG1-201ENST00000323851 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.621e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 PNPLA8-203ENST00000422087 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 NDRG1-229ENST00000537882 2975 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.681e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 PNPLA8-201ENST00000257694 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 TGFBR1-209ENST00000552516 5933 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 ZNF605-203ENST00000381215 1143 ntTSL 1 (best)10.64□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 WWC2-202ENST00000427431 6373 ntTSL 210.59□□□□□ -0.711e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 NDRG1-218ENST00000521438 2810 ntTSL 210.39□□□□□ -0.751e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 P4HA2-207ENST00000401867 3349 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.761e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 ZNF605-205ENST00000412621 541 ntTSL 49.29□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 NDRG1-212ENST00000519278 3983 ntTSL 29.03□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.031e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 RNF219-201ENST00000282003 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.11e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 WWC2-203ENST00000438543 3824 ntTSL 27.59□□□□□ -1.191e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.341e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC6.3□□□□□ -1.41e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.711e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.741e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.941e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 DNAJB14-205ENST00000442697 6075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.512e-6■■■■■ 31.3
FUBP3Q96I24 RELN-204ENST00000429186 891 ntTSL 56.6□□□□□ -1.352e-12■■■■■ 31.2
FUBP3Q96I24 DIP2C-205ENST00000634311 4961 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 31.2
FUBP3Q96I24 DIP2C-201ENST00000280886 7888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.782e-6■■■■■ 31.2
FUBP3Q96I24 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.131e-8■■■■■ 31
FUBP3Q96I24 DUSP6-201ENST00000279488 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.649e-13■■■■■ 31
FUBP3Q96I24 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 31
FUBP3Q96I24 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.453e-8■■■■■ 31
FUBP3Q96I24 OTUD4-203ENST00000455611 2498 ntTSL 51.83□□□□□ -2.123e-8■■■■■ 31
FUBP3Q96I24 C4orf3-201ENST00000399075 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.584e-10■■■■■ 30.8
FUBP3Q96I24 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.257e-8■■■■■ 30.8
FUBP3Q96I24 SBNO2-207ENST00000590176 561 ntTSL 420.3■□□□□ 0.848e-8■■■■■ 30.8
FUBP3Q96I24 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.758e-8■■■■■ 30.8
FUBP3Q96I24 ACADM-211ENST00000528016 546 ntTSL 419.49■□□□□ 0.718e-8■■■■■ 30.8
FUBP3Q96I24 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.528e-8■■■■■ 30.8
FUBP3Q96I24 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.438e-8■■■■■ 30.8
FUBP3Q96I24 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.178e-8■■■■■ 30.8
FUBP3Q96I24 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.298e-8■■■■■ 30.8
FUBP3Q96I24 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.398e-8■■■■■ 30.8
FUBP3Q96I24 C9orf64-201ENST00000314700 2067 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.428e-8■■■■■ 30.8
FUBP3Q96I24 TMED10-205ENST00000556969 1314 ntTSL 26.6□□□□□ -1.351e-14■■■■■ 30.8
FUBP3Q96I24 ACADM-205ENST00000481374 666 ntTSL 35.9□□□□□ -1.468e-8■■■■■ 30.8
FUBP3Q96I24 PPFIA1-212ENST00000528853 745 ntTSL 35.5□□□□□ -1.538e-8■■■■■ 30.8
FUBP3Q96I24 ACADM-212ENST00000529059 1357 ntTSL 25.29□□□□□ -1.568e-8■■■■■ 30.8
FUBP3Q96I24 ACADM-206ENST00000525808 1422 ntTSL 24.95□□□□□ -1.628e-8■■■■■ 30.8
FUBP3Q96I24 ACADM-209ENST00000526196 1451 ntTSL 1 (best)4.36□□□□□ -1.718e-8■■■■■ 30.8
FUBP3Q96I24 ASGR2-205ENST00000574868 1202 ntTSL 516.57■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 30.7
FUBP3Q96I24 ASGR2-204ENST00000450034 932 ntTSL 215.1■□□□□ 0.015e-7■■■■■ 30.7
FUBP3Q96I24 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 30.7
FUBP3Q96I24 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.211e-6■■■■■ 30.7
FUBP3Q96I24 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 30.7
FUBP3Q96I24 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.361e-6■■■■■ 30.7
FUBP3Q96I24 AHR-202ENST00000463496 4820 ntTSL 1 (best)17.79■□□□□ 0.447e-11■■■■■ 30.6
FUBP3Q96I24 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.077e-11■■■■■ 30.6
FUBP3Q96I24 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.797e-11■■■■■ 30.6
FUBP3Q96I24 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 30.5
FUBP3Q96I24 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 30.5
FUBP3Q96I24 MEF2D-204ENST00000464356 5598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.341e-6■■■■■ 30.5
FUBP3Q96I24 MEF2D-202ENST00000360595 3194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 30.5
FUBP3Q96I24 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.046e-7■■■■■ 30.3
FUBP3Q96I24 FNDC3B-201ENST00000336824 7904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 30.2
FUBP3Q96I24 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.391e-7■■■■■ 30.2
FUBP3Q96I24 ZNF217-204ENST00000437222 746 ntTSL 210.8□□□□□ -0.683e-22■■■■■ 30.1
FUBP3Q96I24 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.252e-7■■■■■ 30.1
Retrieved 100 of 4,568 protein–RNA pairs in 166.2 ms