Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCN3Q96D15 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCN3Q96D15 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RCN3Q96D15 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RCN3Q96D15 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RCN3Q96D15 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCN3Q96D15 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCN3Q96D15 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RCN3Q96D15 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCN3Q96D15 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCN3Q96D15 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCN3Q96D15 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RCN3Q96D15 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RCN3Q96D15 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCN3Q96D15 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCN3Q96D15 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCN3Q96D15 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCN3Q96D15 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCN3Q96D15 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCN3Q96D15 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCN3Q96D15 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RCN3Q96D15 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCN3Q96D15 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCN3Q96D15 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCN3Q96D15 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCN3Q96D15 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms