Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI9

GATAD2B, Transcriptional repressor p66-beta, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATAD2BQ8WXI9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATAD2BQ8WXI9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATAD2BQ8WXI9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATAD2BQ8WXI9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATAD2BQ8WXI9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATAD2BQ8WXI9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GATAD2BQ8WXI9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATAD2BQ8WXI9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATAD2BQ8WXI9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GATAD2BQ8WXI9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GATAD2BQ8WXI9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GATAD2BQ8WXI9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GATAD2BQ8WXI9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GATAD2BQ8WXI9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATAD2BQ8WXI9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATAD2BQ8WXI9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATAD2BQ8WXI9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GATAD2BQ8WXI9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATAD2BQ8WXI9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATAD2BQ8WXI9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GATAD2BQ8WXI9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATAD2BQ8WXI9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATAD2BQ8WXI9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GATAD2BQ8WXI9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GATAD2BQ8WXI9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATAD2BQ8WXI9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATAD2BQ8WXI9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GATAD2BQ8WXI9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATAD2BQ8WXI9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GATAD2BQ8WXI9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATAD2BQ8WXI9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GATAD2BQ8WXI9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GATAD2BQ8WXI9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATAD2BQ8WXI9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATAD2BQ8WXI9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATAD2BQ8WXI9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATAD2BQ8WXI9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GATAD2BQ8WXI9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GATAD2BQ8WXI9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATAD2BQ8WXI9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATAD2BQ8WXI9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GATAD2BQ8WXI9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATAD2BQ8WXI9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATAD2BQ8WXI9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATAD2BQ8WXI9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATAD2BQ8WXI9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GATAD2BQ8WXI9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GATAD2BQ8WXI9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATAD2BQ8WXI9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATAD2BQ8WXI9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GATAD2BQ8WXI9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATAD2BQ8WXI9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GATAD2BQ8WXI9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATAD2BQ8WXI9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATAD2BQ8WXI9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATAD2BQ8WXI9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATAD2BQ8WXI9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATAD2BQ8WXI9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATAD2BQ8WXI9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GATAD2BQ8WXI9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATAD2BQ8WXI9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GATAD2BQ8WXI9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATAD2BQ8WXI9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATAD2BQ8WXI9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATAD2BQ8WXI9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATAD2BQ8WXI9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GATAD2BQ8WXI9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATAD2BQ8WXI9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GATAD2BQ8WXI9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.5 ms