Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF5

ZNRF4, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF4, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF4Q8WWF5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNRF4Q8WWF5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF4Q8WWF5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF4Q8WWF5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF4Q8WWF5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF4Q8WWF5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNRF4Q8WWF5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF4Q8WWF5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF4Q8WWF5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF4Q8WWF5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNRF4Q8WWF5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF4Q8WWF5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF4Q8WWF5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNRF4Q8WWF5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF4Q8WWF5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF4Q8WWF5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF4Q8WWF5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF4Q8WWF5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNRF4Q8WWF5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNRF4Q8WWF5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNRF4Q8WWF5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNRF4Q8WWF5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNRF4Q8WWF5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF4Q8WWF5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF4Q8WWF5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF4Q8WWF5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNRF4Q8WWF5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNRF4Q8WWF5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNRF4Q8WWF5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF4Q8WWF5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF4Q8WWF5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNRF4Q8WWF5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF4Q8WWF5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNRF4Q8WWF5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF4Q8WWF5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF4Q8WWF5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNRF4Q8WWF5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF4Q8WWF5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF4Q8WWF5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF4Q8WWF5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF4Q8WWF5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNRF4Q8WWF5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNRF4Q8WWF5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNRF4Q8WWF5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms