Protein–RNA interactions for Protein: Q5TD94

RSPH4A, Radial spoke head protein 4 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH4AQ5TD94 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
RSPH4AQ5TD94 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
RSPH4AQ5TD94 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
RSPH4AQ5TD94 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
RSPH4AQ5TD94 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
RSPH4AQ5TD94 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
RSPH4AQ5TD94 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
RSPH4AQ5TD94 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
RSPH4AQ5TD94 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
RSPH4AQ5TD94 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
RSPH4AQ5TD94 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
RSPH4AQ5TD94 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC39.68■■■■□ 3.94
RSPH4AQ5TD94 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
RSPH4AQ5TD94 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
RSPH4AQ5TD94 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
RSPH4AQ5TD94 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC39.67■■■■□ 3.94
RSPH4AQ5TD94 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
RSPH4AQ5TD94 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
RSPH4AQ5TD94 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
RSPH4AQ5TD94 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
RSPH4AQ5TD94 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC39.65■■■■□ 3.94
RSPH4AQ5TD94 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
RSPH4AQ5TD94 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
RSPH4AQ5TD94 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC39.63■■■■□ 3.94
RSPH4AQ5TD94 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
RSPH4AQ5TD94 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
RSPH4AQ5TD94 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
RSPH4AQ5TD94 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
RSPH4AQ5TD94 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
RSPH4AQ5TD94 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
RSPH4AQ5TD94 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC39.56■■■■□ 3.92
RSPH4AQ5TD94 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
RSPH4AQ5TD94 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
RSPH4AQ5TD94 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
RSPH4AQ5TD94 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
RSPH4AQ5TD94 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
RSPH4AQ5TD94 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
RSPH4AQ5TD94 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
RSPH4AQ5TD94 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
RSPH4AQ5TD94 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
RSPH4AQ5TD94 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
RSPH4AQ5TD94 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
RSPH4AQ5TD94 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC39.48■■■■□ 3.91
RSPH4AQ5TD94 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
RSPH4AQ5TD94 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
RSPH4AQ5TD94 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
RSPH4AQ5TD94 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
RSPH4AQ5TD94 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
RSPH4AQ5TD94 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
RSPH4AQ5TD94 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
RSPH4AQ5TD94 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
RSPH4AQ5TD94 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
RSPH4AQ5TD94 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
RSPH4AQ5TD94 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
RSPH4AQ5TD94 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
RSPH4AQ5TD94 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
RSPH4AQ5TD94 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
RSPH4AQ5TD94 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
RSPH4AQ5TD94 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
RSPH4AQ5TD94 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
RSPH4AQ5TD94 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC39.37■■■■□ 3.89
RSPH4AQ5TD94 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.36■■■■□ 3.89
RSPH4AQ5TD94 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
RSPH4AQ5TD94 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
RSPH4AQ5TD94 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
RSPH4AQ5TD94 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
RSPH4AQ5TD94 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
RSPH4AQ5TD94 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
RSPH4AQ5TD94 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
RSPH4AQ5TD94 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
RSPH4AQ5TD94 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.33■■■■□ 3.89
RSPH4AQ5TD94 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
RSPH4AQ5TD94 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC39.31■■■■□ 3.88
RSPH4AQ5TD94 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
RSPH4AQ5TD94 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RSPH4AQ5TD94 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RSPH4AQ5TD94 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RSPH4AQ5TD94 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
RSPH4AQ5TD94 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
RSPH4AQ5TD94 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
RSPH4AQ5TD94 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
RSPH4AQ5TD94 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC39.27■■■■□ 3.88
RSPH4AQ5TD94 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
RSPH4AQ5TD94 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
RSPH4AQ5TD94 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
RSPH4AQ5TD94 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
RSPH4AQ5TD94 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
RSPH4AQ5TD94 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
RSPH4AQ5TD94 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
RSPH4AQ5TD94 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
RSPH4AQ5TD94 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC39.21■■■■□ 3.87
RSPH4AQ5TD94 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
RSPH4AQ5TD94 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
RSPH4AQ5TD94 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
RSPH4AQ5TD94 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
RSPH4AQ5TD94 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
RSPH4AQ5TD94 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RSPH4AQ5TD94 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
RSPH4AQ5TD94 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
RSPH4AQ5TD94 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.17■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms