Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TIMM23BQ5SRD1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM23BQ5SRD1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM23BQ5SRD1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM23BQ5SRD1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM23BQ5SRD1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TIMM23BQ5SRD1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM23BQ5SRD1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM23BQ5SRD1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM23BQ5SRD1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TIMM23BQ5SRD1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM23BQ5SRD1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM23BQ5SRD1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM23BQ5SRD1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM23BQ5SRD1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM23BQ5SRD1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM23BQ5SRD1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TIMM23BQ5SRD1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TIMM23BQ5SRD1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TIMM23BQ5SRD1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM23BQ5SRD1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM23BQ5SRD1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM23BQ5SRD1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TIMM23BQ5SRD1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM23BQ5SRD1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM23BQ5SRD1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TIMM23BQ5SRD1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TIMM23BQ5SRD1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM23BQ5SRD1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM23BQ5SRD1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TIMM23BQ5SRD1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM23BQ5SRD1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM23BQ5SRD1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TIMM23BQ5SRD1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM23BQ5SRD1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM23BQ5SRD1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TIMM23BQ5SRD1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TIMM23BQ5SRD1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM23BQ5SRD1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM23BQ5SRD1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM23BQ5SRD1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM23BQ5SRD1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TIMM23BQ5SRD1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TIMM23BQ5SRD1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM23BQ5SRD1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TIMM23BQ5SRD1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms