Protein–RNA interactions for Protein: Q5BN46

C9orf116, UPF0691 protein C9orf116, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf116Q5BN46 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf116Q5BN46 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf116Q5BN46 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
C9orf116Q5BN46 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
C9orf116Q5BN46 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.8 ms