Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ODF2Q5BJF6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ODF2Q5BJF6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ODF2Q5BJF6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ODF2Q5BJF6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ODF2Q5BJF6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ODF2Q5BJF6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ODF2Q5BJF6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ODF2Q5BJF6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ODF2Q5BJF6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ODF2Q5BJF6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ODF2Q5BJF6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ODF2Q5BJF6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ODF2Q5BJF6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ODF2Q5BJF6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ODF2Q5BJF6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ODF2Q5BJF6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ODF2Q5BJF6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ODF2Q5BJF6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ODF2Q5BJF6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ODF2Q5BJF6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ODF2Q5BJF6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ODF2Q5BJF6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ODF2Q5BJF6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ODF2Q5BJF6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ODF2Q5BJF6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ODF2Q5BJF6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ODF2Q5BJF6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ODF2Q5BJF6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ODF2Q5BJF6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ODF2Q5BJF6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ODF2Q5BJF6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ODF2Q5BJF6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ODF2Q5BJF6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ODF2Q5BJF6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ODF2Q5BJF6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ODF2Q5BJF6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ODF2Q5BJF6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms