Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LONRF1Q17RB8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LONRF1Q17RB8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LONRF1Q17RB8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LONRF1Q17RB8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LONRF1Q17RB8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LONRF1Q17RB8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LONRF1Q17RB8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LONRF1Q17RB8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LONRF1Q17RB8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LONRF1Q17RB8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LONRF1Q17RB8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LONRF1Q17RB8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LONRF1Q17RB8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LONRF1Q17RB8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LONRF1Q17RB8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LONRF1Q17RB8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LONRF1Q17RB8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LONRF1Q17RB8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LONRF1Q17RB8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LONRF1Q17RB8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LONRF1Q17RB8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LONRF1Q17RB8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LONRF1Q17RB8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
LONRF1Q17RB8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LONRF1Q17RB8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LONRF1Q17RB8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
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