Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
LMAN2Q12907 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LMAN2Q12907 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMAN2Q12907 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMAN2Q12907 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMAN2Q12907 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMAN2Q12907 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMAN2Q12907 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMAN2Q12907 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMAN2Q12907 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMAN2Q12907 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LMAN2Q12907 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMAN2Q12907 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMAN2Q12907 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMAN2Q12907 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMAN2Q12907 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMAN2Q12907 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMAN2Q12907 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LMAN2Q12907 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMAN2Q12907 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMAN2Q12907 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMAN2Q12907 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMAN2Q12907 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LMAN2Q12907 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LMAN2Q12907 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMAN2Q12907 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMAN2Q12907 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMAN2Q12907 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMAN2Q12907 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMAN2Q12907 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMAN2Q12907 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMAN2Q12907 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMAN2Q12907 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
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