Protein–RNA interactions for Protein: Q08054

CSI2, Chitin synthase 3 complex protein CSI2, yeastyeast

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSI2Q08054 NAS2YIL007C 663 nt7.13□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 LAS17YOR181W 1902 nt7.13□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.12□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.12□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.12□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.12□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.12□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.12□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.12□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.12□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.12□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.12□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.12□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 OPI3YJR073C 621 nt7.12□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 IPL1YPL209C 1104 nt7.12□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 LSR1LSR1 1175 nt7.11□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 MET30YIL046W 1923 nt7.1□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 YCR025CYCR025C 411 nt7.1□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 AIM1YAL046C 357 nt7.1□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 KRE1YNL322C 942 nt7.1□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 POP2YNR052C 1302 nt7.09□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 FLX1YIL134W 936 nt7.09□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 SAC7YDR389W 1965 nt7.09□□□□□ -1.27
CSI2Q08054 HEM14YER014W 1620 nt7.08□□□□□ -1.28
CSI2Q08054 SWM1YDR260C 513 nt7.07□□□□□ -1.28
CSI2Q08054 AMF1YOR378W 1548 nt7.06□□□□□ -1.28
CSI2Q08054 SAM50YNL026W 1455 nt7.06□□□□□ -1.28
CSI2Q08054 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.06□□□□□ -1.28
CSI2Q08054 SOD2YHR008C 702 nt7.06□□□□□ -1.28
CSI2Q08054 YNR064CYNR064C 873 nt7.06□□□□□ -1.28
CSI2Q08054 PMA2YPL036W 2844 nt7.06□□□□□ -1.28
CSI2Q08054 ERG6YML008C 1152 nt7.05□□□□□ -1.28
CSI2Q08054 SPE2YOL052C 1191 nt7.04□□□□□ -1.28
CSI2Q08054 PHB2YGR231C 933 nt7.03□□□□□ -1.28
CSI2Q08054 YLR046CYLR046C 813 nt7.03□□□□□ -1.28
CSI2Q08054 ADH3YMR083W 1128 nt7.03□□□□□ -1.28
CSI2Q08054 RIM2YBR192W 1134 nt7.03□□□□□ -1.28
CSI2Q08054 ENO2YHR174W 1314 nt7.02□□□□□ -1.28
CSI2Q08054 RPD3YNL330C 1302 nt7.02□□□□□ -1.28
CSI2Q08054 LEU2YCL018W 1095 nt7.02□□□□□ -1.29
CSI2Q08054 CYC3YAL039C 810 nt7.01□□□□□ -1.29
CSI2Q08054 ADE16YLR028C 1776 nt7□□□□□ -1.29
CSI2Q08054 DLD3YEL071W 1491 nt7□□□□□ -1.29
CSI2Q08054 TPC1YGR096W 945 nt7□□□□□ -1.29
CSI2Q08054 ORT1YOR130C 879 nt7□□□□□ -1.29
CSI2Q08054 LYS20YDL182W 1287 nt6.99□□□□□ -1.29
CSI2Q08054 SER2YGR208W 930 nt6.99□□□□□ -1.29
CSI2Q08054 SWT21YNL187W 1074 nt6.99□□□□□ -1.29
CSI2Q08054 YRF1-1YDR545W 5391 nt6.99□□□□□ -1.29
CSI2Q08054 YRF1-5YLR467W 5391 nt6.99□□□□□ -1.29
CSI2Q08054 YRF1-8YOR396W 5391 nt6.99□□□□□ -1.29
CSI2Q08054 KEL3YPL263C 1956 nt6.99□□□□□ -1.29
CSI2Q08054 DPL1YDR294C 1770 nt6.98□□□□□ -1.29
CSI2Q08054 SRP102YKL154W 735 nt6.98□□□□□ -1.29
CSI2Q08054 YMR007WYMR007W 381 nt6.98□□□□□ -1.29
CSI2Q08054 NSG2YNL156C 900 nt6.98□□□□□ -1.29
CSI2Q08054 FRT1YOR324C 1809 nt6.98□□□□□ -1.29
CSI2Q08054 THI6YPL214C 1623 nt6.98□□□□□ -1.29
CSI2Q08054 HTS1YPR033C 1641 nt6.98□□□□□ -1.29
CSI2Q08054 MOB1YIL106W 945 nt6.97□□□□□ -1.29
CSI2Q08054 INH1YDL181W 258 nt6.96□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 YER152W-AYER152W-A 567 nt6.96□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 SDS24YBR214W 1584 nt6.95□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 AIM34YMR003W 597 nt6.95□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 RPC31YNL151C 756 nt6.95□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 RCR1YBR005W 642 nt6.95□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 snR31snR31 225 nt6.95□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 snR4snR4 186 nt6.95□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 HXT11YOL156W 1704 nt6.95□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 NAM8YHR086W 1572 nt6.95□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 PFS2YNL317W 1398 nt6.95□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 ELO1YJL196C 933 nt6.94□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 YKR012CYKR012C 378 nt6.94□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 YLR173WYLR173W 1827 nt6.94□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 AFG2YLR397C 2343 nt6.94□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 LEU4YNL104C 1860 nt6.94□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 NPP2YEL016C 1482 nt6.93□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 RTG2YGL252C 1767 nt6.93□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 REX2YLR059C 810 nt6.93□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 ENO1YGR254W 1314 nt6.93□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 YMR265CYMR265C 1386 nt6.93□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 ITR2YOL103W 1830 nt6.92□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 KRR1YCL059C 951 nt6.92□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 HAP5YOR358W 729 nt6.92□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 ITR1YDR497C 1755 nt6.92□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 ECM10YEL030W 1935 nt6.91□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 TOP3YLR234W 1971 nt6.91□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 SUV3YPL029W 2214 nt6.91□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 RPN14YGL004C 1254 nt6.91□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 VMA11YPL234C 495 nt6.91□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 VBA3YCL069W 1377 nt6.91□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 GCD11YER025W 1584 nt6.91□□□□□ -1.3
CSI2Q08054 MET1YKR069W 1782 nt6.9□□□□□ -1.31
CSI2Q08054 TRP2YER090W 1524 nt6.89□□□□□ -1.31
CSI2Q08054 ERO1YML130C 1692 nt6.89□□□□□ -1.31
CSI2Q08054 YGR210CYGR210C 1236 nt6.88□□□□□ -1.31
CSI2Q08054 YPT11YNL304W 1254 nt6.88□□□□□ -1.31
CSI2Q08054 YRF1-3YGR296W 5580 nt6.88□□□□□ -1.31
CSI2Q08054 YRF1-6YNL339C 5580 nt6.88□□□□□ -1.31
CSI2Q08054 YRF1-7YPL283C 5580 nt6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 61.7 ms