Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSBP1Q04837 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSBP1Q04837 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSBP1Q04837 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSBP1Q04837 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSBP1Q04837 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSBP1Q04837 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSBP1Q04837 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSBP1Q04837 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSBP1Q04837 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SSBP1Q04837 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSBP1Q04837 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSBP1Q04837 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSBP1Q04837 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSBP1Q04837 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSBP1Q04837 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSBP1Q04837 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SSBP1Q04837 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSBP1Q04837 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSBP1Q04837 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSBP1Q04837 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSBP1Q04837 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSBP1Q04837 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SSBP1Q04837 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SSBP1Q04837 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SSBP1Q04837 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SSBP1Q04837 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms