Protein–RNA interactions for Protein: Q02948

VPS30, Vacuolar protein sorting-associated protein 30, yeastyeast

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS30Q02948 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9.6□□□□□ -0.87
VPS30Q02948 MET1YKR069W 1782 nt9.6□□□□□ -0.87
VPS30Q02948 MET8YBR213W 825 nt9.59□□□□□ -0.87
VPS30Q02948 YHR219WYHR219W 1875 nt9.58□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 MTO1YGL236C 2010 nt9.58□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 YMR265CYMR265C 1386 nt9.56□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 REX2YLR059C 810 nt9.56□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 HAP5YOR358W 729 nt9.56□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 HTS1YPR033C 1641 nt9.56□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 SGA1YIL099W 1650 nt9.55□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 VBA3YCL069W 1377 nt9.55□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 MRS6YOR370C 1812 nt9.55□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 YKL053WYKL053W 375 nt9.55□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 YMR007WYMR007W 381 nt9.55□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 LSR1LSR1 1175 nt9.55□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 VMA11YPL234C 495 nt9.55□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 snR31snR31 225 nt9.55□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 ENO1YGR254W 1314 nt9.55□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 POP2YNR052C 1302 nt9.55□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 YKL133CYKL133C 1392 nt9.54□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 YER152W-AYER152W-A 567 nt9.54□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 CSM2YIL132C 642 nt9.54□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 SRP102YKL154W 735 nt9.54□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 CRC1YOR100C 984 nt9.53□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 ZAP1YJL056C 2643 nt9.52□□□□□ -0.88
VPS30Q02948 YHR218WYHR218W 1812 nt9.52□□□□□ -0.89
VPS30Q02948 RPN14YGL004C 1254 nt9.52□□□□□ -0.89
VPS30Q02948 ERO1YML130C 1692 nt9.51□□□□□ -0.89
VPS30Q02948 TOK1YJL093C 2076 nt9.51□□□□□ -0.89
VPS30Q02948 TGA1tA(UGC)A 73 nt9.51□□□□□ -0.89
VPS30Q02948 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt9.51□□□□□ -0.89
VPS30Q02948 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt9.51□□□□□ -0.89
VPS30Q02948 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt9.51□□□□□ -0.89
VPS30Q02948 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt9.51□□□□□ -0.89
VPS30Q02948 YLR280CYLR280C 351 nt9.51□□□□□ -0.89
VPS30Q02948 SRP54YPR088C 1626 nt9.51□□□□□ -0.89
VPS30Q02948 YGR210CYGR210C 1236 nt9.49□□□□□ -0.89
VPS30Q02948 MDL2YPL270W 2322 nt9.48□□□□□ -0.89
VPS30Q02948 RCR1YBR005W 642 nt9.48□□□□□ -0.89
VPS30Q02948 SNX3YOR357C 489 nt9.48□□□□□ -0.89
VPS30Q02948 SAN1YDR143C 1833 nt9.47□□□□□ -0.89
VPS30Q02948 RPD3YNL330C 1302 nt9.47□□□□□ -0.89
VPS30Q02948 FCY1YPR062W 477 nt9.46□□□□□ -0.9
VPS30Q02948 Q0010Q0010 387 nt9.46□□□□□ -0.9
VPS30Q02948 MEX67YPL169C 1800 nt9.46□□□□□ -0.9
VPS30Q02948 KGD2YDR148C 1392 nt9.42□□□□□ -0.9
VPS30Q02948 MAS1YLR163C 1389 nt9.42□□□□□ -0.9
VPS30Q02948 YFR020WYFR020W 699 nt9.42□□□□□ -0.9
VPS30Q02948 YPT11YNL304W 1254 nt9.42□□□□□ -0.9
VPS30Q02948 RIM2YBR192W 1134 nt9.42□□□□□ -0.9
VPS30Q02948 RFC1YOR217W 2586 nt9.42□□□□□ -0.9
VPS30Q02948 BUD20YLR074C 501 nt9.4□□□□□ -0.9
VPS30Q02948 YPL108WYPL108W 507 nt9.4□□□□□ -0.9
VPS30Q02948 SSL2YIL143C 2532 nt9.38□□□□□ -0.91
VPS30Q02948 ODC1YPL134C 933 nt9.37□□□□□ -0.91
VPS30Q02948 CWP2YKL096W-A 279 nt9.36□□□□□ -0.91
VPS30Q02948 GAS1YMR307W 1680 nt9.36□□□□□ -0.91
VPS30Q02948 PTC6YCR079W 1329 nt9.35□□□□□ -0.91
VPS30Q02948 TPN1YGL186C 1740 nt9.35□□□□□ -0.91
VPS30Q02948 SBP1YHL034C 885 nt9.35□□□□□ -0.91
VPS30Q02948 YJL160CYJL160C 864 nt9.35□□□□□ -0.91
VPS30Q02948 MCM5YLR274W 2328 nt9.35□□□□□ -0.91
VPS30Q02948 RSM7YJR113C 744 nt9.33□□□□□ -0.92
VPS30Q02948 PAU21YOR394W 495 nt9.33□□□□□ -0.92
VPS30Q02948 PAU22YPL282C 495 nt9.33□□□□□ -0.92
VPS30Q02948 KRR1YCL059C 951 nt9.32□□□□□ -0.92
VPS30Q02948 EMC3YKL207W 762 nt9.32□□□□□ -0.92
VPS30Q02948 RPC31YNL151C 756 nt9.32□□□□□ -0.92
VPS30Q02948 GRH1YDR517W 1119 nt9.31□□□□□ -0.92
VPS30Q02948 UFD1YGR048W 1086 nt9.31□□□□□ -0.92
VPS30Q02948 YMR166CYMR166C 1107 nt9.3□□□□□ -0.92
VPS30Q02948 YOR343CYOR343C 327 nt9.3□□□□□ -0.92
VPS30Q02948 YMR210WYMR210W 1350 nt9.29□□□□□ -0.92
VPS30Q02948 LSP1YPL004C 1026 nt9.29□□□□□ -0.92
VPS30Q02948 LPD1YFL018C 1500 nt9.29□□□□□ -0.92
VPS30Q02948 DPL1YDR294C 1770 nt9.29□□□□□ -0.92
VPS30Q02948 HXT10YFL011W 1641 nt9.27□□□□□ -0.92
VPS30Q02948 PET18YCR020C 648 nt9.26□□□□□ -0.93
VPS30Q02948 TOM71YHR117W 1920 nt9.26□□□□□ -0.93
VPS30Q02948 NBA1YOL070C 1506 nt9.26□□□□□ -0.93
VPS30Q02948 HRA1HRA1 564 nt9.25□□□□□ -0.93
VPS30Q02948 YJR154WYJR154W 1041 nt9.25□□□□□ -0.93
VPS30Q02948 YRF1-2YER190W 5046 nt9.25□□□□□ -0.93
VPS30Q02948 MDM35YKL053C-A 261 nt9.24□□□□□ -0.93
VPS30Q02948 THI3YDL080C 1830 nt9.22□□□□□ -0.93
VPS30Q02948 YLR460CYLR460C 1131 nt9.22□□□□□ -0.93
VPS30Q02948 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt9.22□□□□□ -0.93
VPS30Q02948 GGA2YHR108W 1758 nt9.22□□□□□ -0.93
VPS30Q02948 CAK1YFL029C 1107 nt9.21□□□□□ -0.94
VPS30Q02948 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt9.21□□□□□ -0.94
VPS30Q02948 FIT1YDR534C 1587 nt9.2□□□□□ -0.94
VPS30Q02948 MRP1YDR347W 966 nt9.2□□□□□ -0.94
VPS30Q02948 RPL12BYDR418W 498 nt9.2□□□□□ -0.94
VPS30Q02948 RRT14YIL127C 621 nt9.2□□□□□ -0.94
VPS30Q02948 MET22YOL064C 1074 nt9.19□□□□□ -0.94
VPS30Q02948 OCH1YGL038C 1443 nt9.19□□□□□ -0.94
VPS30Q02948 UTR5YEL035C 501 nt9.17□□□□□ -0.94
VPS30Q02948 CHS7YHR142W 951 nt9.17□□□□□ -0.94
VPS30Q02948 GPM1YKL152C 744 nt9.17□□□□□ -0.94
VPS30Q02948 MIM1YOL026C 342 nt9.17□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.3 ms