Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTBP60709 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTBP60709 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ACTBP60709 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTBP60709 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTBP60709 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTBP60709 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTBP60709 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTBP60709 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTBP60709 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ACTBP60709 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTBP60709 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTBP60709 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ACTBP60709 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTBP60709 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTBP60709 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTBP60709 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTBP60709 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ACTBP60709 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTBP60709 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTBP60709 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTBP60709 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTBP60709 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ACTBP60709 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTBP60709 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ACTBP60709 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTBP60709 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTBP60709 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTBP60709 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ACTBP60709 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTBP60709 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTBP60709 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTBP60709 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ACTBP60709 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTBP60709 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTBP60709 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTBP60709 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTBP60709 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTBP60709 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTBP60709 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTBP60709 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ACTBP60709 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTBP60709 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTBP60709 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ACTBP60709 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTBP60709 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTBP60709 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTBP60709 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTBP60709 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ACTBP60709 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ACTBP60709 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTBP60709 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTBP60709 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTBP60709 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTBP60709 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ACTBP60709 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTBP60709 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTBP60709 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTBP60709 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ACTBP60709 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTBP60709 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ACTBP60709 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTBP60709 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTBP60709 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ACTBP60709 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTBP60709 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTBP60709 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTBP60709 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ACTBP60709 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTBP60709 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTBP60709 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ACTBP60709 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTBP60709 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTBP60709 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTBP60709 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTBP60709 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ACTBP60709 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTBP60709 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTBP60709 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTBP60709 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTBP60709 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTBP60709 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTBP60709 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTBP60709 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTBP60709 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTBP60709 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTBP60709 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTBP60709 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTBP60709 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTBP60709 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTBP60709 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTBP60709 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTBP60709 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTBP60709 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTBP60709 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTBP60709 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTBP60709 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTBP60709 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTBP60709 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTBP60709 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms