Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLTPP55058 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLTPP55058 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLTPP55058 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLTPP55058 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLTPP55058 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLTPP55058 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLTPP55058 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLTPP55058 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLTPP55058 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLTPP55058 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLTPP55058 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLTPP55058 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLTPP55058 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLTPP55058 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLTPP55058 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLTPP55058 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLTPP55058 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLTPP55058 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLTPP55058 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLTPP55058 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLTPP55058 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLTPP55058 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLTPP55058 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLTPP55058 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLTPP55058 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLTPP55058 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLTPP55058 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLTPP55058 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PLTPP55058 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLTPP55058 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PLTPP55058 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLTPP55058 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PLTPP55058 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PLTPP55058 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLTPP55058 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLTPP55058 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLTPP55058 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLTPP55058 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PLTPP55058 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PLTPP55058 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLTPP55058 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLTPP55058 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PLTPP55058 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLTPP55058 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLTPP55058 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLTPP55058 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PLTPP55058 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PLTPP55058 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLTPP55058 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLTPP55058 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLTPP55058 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PLTPP55058 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLTPP55058 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLTPP55058 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLTPP55058 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLTPP55058 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PLTPP55058 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLTPP55058 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PLTPP55058 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLTPP55058 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLTPP55058 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLTPP55058 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLTPP55058 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLTPP55058 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLTPP55058 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PLTPP55058 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PLTPP55058 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PLTPP55058 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLTPP55058 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLTPP55058 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLTPP55058 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLTPP55058 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLTPP55058 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLTPP55058 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLTPP55058 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PLTPP55058 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLTPP55058 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PLTPP55058 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLTPP55058 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLTPP55058 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLTPP55058 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLTPP55058 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PLTPP55058 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PLTPP55058 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLTPP55058 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PLTPP55058 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLTPP55058 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLTPP55058 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PLTPP55058 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLTPP55058 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLTPP55058 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLTPP55058 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLTPP55058 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLTPP55058 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PLTPP55058 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLTPP55058 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLTPP55058 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLTPP55058 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PLTPP55058 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1300 ms