Protein–RNA interactions for Protein: P53011

SEH1, Nucleoporin SEH1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEH1P53011 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.75□□□□□ -1.17
SEH1P53011 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.75□□□□□ -1.17
SEH1P53011 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.75□□□□□ -1.17
SEH1P53011 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.75□□□□□ -1.17
SEH1P53011 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.75□□□□□ -1.17
SEH1P53011 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.75□□□□□ -1.17
SEH1P53011 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.75□□□□□ -1.17
SEH1P53011 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.75□□□□□ -1.17
SEH1P53011 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.75□□□□□ -1.17
SEH1P53011 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.75□□□□□ -1.17
SEH1P53011 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.75□□□□□ -1.17
SEH1P53011 UFD1YGR048W 1086 nt7.75□□□□□ -1.17
SEH1P53011 SWT21YNL187W 1074 nt7.75□□□□□ -1.17
SEH1P53011 VMA11YPL234C 495 nt7.75□□□□□ -1.17
SEH1P53011 GCD11YER025W 1584 nt7.74□□□□□ -1.17
SEH1P53011 YMR265CYMR265C 1386 nt7.73□□□□□ -1.17
SEH1P53011 MCM5YLR274W 2328 nt7.73□□□□□ -1.17
SEH1P53011 SOD2YHR008C 702 nt7.73□□□□□ -1.17
SEH1P53011 HAP5YOR358W 729 nt7.73□□□□□ -1.17
SEH1P53011 snR31snR31 225 nt7.73□□□□□ -1.17
SEH1P53011 NAM8YHR086W 1572 nt7.72□□□□□ -1.17
SEH1P53011 MET1YKR069W 1782 nt7.72□□□□□ -1.17
SEH1P53011 SAM50YNL026W 1455 nt7.72□□□□□ -1.17
SEH1P53011 RPD3YNL330C 1302 nt7.72□□□□□ -1.17
SEH1P53011 RPN14YGL004C 1254 nt7.71□□□□□ -1.18
SEH1P53011 PHB2YGR231C 933 nt7.71□□□□□ -1.18
SEH1P53011 FLX1YIL134W 936 nt7.71□□□□□ -1.18
SEH1P53011 ADH3YMR083W 1128 nt7.71□□□□□ -1.18
SEH1P53011 ERG6YML008C 1152 nt7.7□□□□□ -1.18
SEH1P53011 SNX3YOR357C 489 nt7.7□□□□□ -1.18
SEH1P53011 FIT1YDR534C 1587 nt7.69□□□□□ -1.18
SEH1P53011 YKR012CYKR012C 378 nt7.69□□□□□ -1.18
SEH1P53011 MOB1YIL106W 945 nt7.68□□□□□ -1.18
SEH1P53011 YKL053WYKL053W 375 nt7.68□□□□□ -1.18
SEH1P53011 CRC1YOR100C 984 nt7.68□□□□□ -1.18
SEH1P53011 ECM10YEL030W 1935 nt7.68□□□□□ -1.18
SEH1P53011 SSL2YIL143C 2532 nt7.67□□□□□ -1.18
SEH1P53011 CWP2YKL096W-A 279 nt7.66□□□□□ -1.18
SEH1P53011 CYC3YAL039C 810 nt7.65□□□□□ -1.18
SEH1P53011 REX2YLR059C 810 nt7.65□□□□□ -1.18
SEH1P53011 SDS24YBR214W 1584 nt7.65□□□□□ -1.18
SEH1P53011 SRP54YPR088C 1626 nt7.64□□□□□ -1.19
SEH1P53011 KRR1YCL059C 951 nt7.63□□□□□ -1.19
SEH1P53011 LYS20YDL182W 1287 nt7.63□□□□□ -1.19
SEH1P53011 VBA3YCL069W 1377 nt7.62□□□□□ -1.19
SEH1P53011 SAN1YDR143C 1833 nt7.62□□□□□ -1.19
SEH1P53011 SWM1YDR260C 513 nt7.62□□□□□ -1.19
SEH1P53011 ODC1YPL134C 933 nt7.62□□□□□ -1.19
SEH1P53011 ENO1YGR254W 1314 nt7.61□□□□□ -1.19
SEH1P53011 SER2YGR208W 930 nt7.61□□□□□ -1.19
SEH1P53011 YMR007WYMR007W 381 nt7.61□□□□□ -1.19
SEH1P53011 RCR1YBR005W 642 nt7.61□□□□□ -1.19
SEH1P53011 RIM2YBR192W 1134 nt7.61□□□□□ -1.19
SEH1P53011 KGD2YDR148C 1392 nt7.6□□□□□ -1.19
SEH1P53011 POP2YNR052C 1302 nt7.6□□□□□ -1.19
SEH1P53011 RPC31YNL151C 756 nt7.6□□□□□ -1.19
SEH1P53011 HTS1YPR033C 1641 nt7.59□□□□□ -1.19
SEH1P53011 PMA2YPL036W 2844 nt7.58□□□□□ -1.2
SEH1P53011 YNL190WYNL190W 615 nt7.58□□□□□ -1.2
SEH1P53011 LAS17YOR181W 1902 nt7.58□□□□□ -1.2
SEH1P53011 MET30YIL046W 1923 nt7.57□□□□□ -1.2
SEH1P53011 SRP102YKL154W 735 nt7.57□□□□□ -1.2
SEH1P53011 YPT11YNL304W 1254 nt7.57□□□□□ -1.2
SEH1P53011 DPL1YDR294C 1770 nt7.56□□□□□ -1.2
SEH1P53011 YLR280CYLR280C 351 nt7.56□□□□□ -1.2
SEH1P53011 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.55□□□□□ -1.2
SEH1P53011 SBP1YHL034C 885 nt7.55□□□□□ -1.2
SEH1P53011 MDM35YKL053C-A 261 nt7.54□□□□□ -1.2
SEH1P53011 MAM3YOL060C 2121 nt7.54□□□□□ -1.2
SEH1P53011 ERO1YML130C 1692 nt7.54□□□□□ -1.2
SEH1P53011 GAS1YMR307W 1680 nt7.54□□□□□ -1.2
SEH1P53011 YFR020WYFR020W 699 nt7.53□□□□□ -1.2
SEH1P53011 PTC6YCR079W 1329 nt7.52□□□□□ -1.2
SEH1P53011 NBA1YOL070C 1506 nt7.52□□□□□ -1.2
SEH1P53011 ADE2YOR128C 1716 nt7.52□□□□□ -1.21
SEH1P53011 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.51□□□□□ -1.21
SEH1P53011 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.51□□□□□ -1.21
SEH1P53011 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.51□□□□□ -1.21
SEH1P53011 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.51□□□□□ -1.21
SEH1P53011 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.51□□□□□ -1.21
SEH1P53011 YGR210CYGR210C 1236 nt7.51□□□□□ -1.21
SEH1P53011 HXT10YFL011W 1641 nt7.5□□□□□ -1.21
SEH1P53011 FCY1YPR062W 477 nt7.5□□□□□ -1.21
SEH1P53011 YDR306CYDR306C 1437 nt7.5□□□□□ -1.21
SEH1P53011 FRT1YOR324C 1809 nt7.5□□□□□ -1.21
SEH1P53011 SNU66YOR308C 1764 nt7.49□□□□□ -1.21
SEH1P53011 RSM7YJR113C 744 nt7.49□□□□□ -1.21
SEH1P53011 CCR4YAL021C 2514 nt7.48□□□□□ -1.21
SEH1P53011 NDE1YMR145C 1683 nt7.48□□□□□ -1.21
SEH1P53011 GGA2YHR108W 1758 nt7.47□□□□□ -1.21
SEH1P53011 BUD20YLR074C 501 nt7.47□□□□□ -1.21
SEH1P53011 LEU4YNL104C 1860 nt7.47□□□□□ -1.21
SEH1P53011 THI3YDL080C 1830 nt7.46□□□□□ -1.21
SEH1P53011 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.46□□□□□ -1.22
SEH1P53011 GPM1YKL152C 744 nt7.45□□□□□ -1.22
SEH1P53011 YPL108WYPL108W 507 nt7.45□□□□□ -1.22
SEH1P53011 AFG2YLR397C 2343 nt7.45□□□□□ -1.22
SEH1P53011 YDR467CYDR467C 327 nt7.44□□□□□ -1.22
SEH1P53011 DUS3YLR401C 2007 nt7.44□□□□□ -1.22
SEH1P53011 MIM1YOL026C 342 nt7.43□□□□□ -1.22
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