Protein–RNA interactions for Protein: P47821

SSN8, RNA polymerase II holoenzyme cyclin-like subunit, yeastyeast

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSN8P47821 YNL040WYNL040W 1371 nt7.59□□□□□ -1.19
SSN8P47821 MAS2YHR024C 1449 nt7.59□□□□□ -1.19
SSN8P47821 CDC13YDL220C 2775 nt7.58□□□□□ -1.2
SSN8P47821 ERG13YML126C 1476 nt7.58□□□□□ -1.2
SSN8P47821 MET1YKR069W 1782 nt7.58□□□□□ -1.2
SSN8P47821 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.57□□□□□ -1.2
SSN8P47821 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.57□□□□□ -1.2
SSN8P47821 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.57□□□□□ -1.2
SSN8P47821 KRR1YCL059C 951 nt7.57□□□□□ -1.2
SSN8P47821 RIM2YBR192W 1134 nt7.57□□□□□ -1.2
SSN8P47821 IMO32YGR031W 1029 nt7.56□□□□□ -1.2
SSN8P47821 YJL195CYJL195C 702 nt7.56□□□□□ -1.2
SSN8P47821 RRT8YOL048C 1029 nt7.55□□□□□ -1.2
SSN8P47821 BAP3YDR046C 1815 nt7.55□□□□□ -1.2
SSN8P47821 YIL177CYIL177C 5277 nt7.54□□□□□ -1.2
SSN8P47821 INH1YDL181W 258 nt7.53□□□□□ -1.2
SSN8P47821 SLM3YDL033C 1254 nt7.52□□□□□ -1.21
SSN8P47821 RPC31YNL151C 756 nt7.52□□□□□ -1.21
SSN8P47821 DPL1YDR294C 1770 nt7.51□□□□□ -1.21
SSN8P47821 ITR2YOL103W 1830 nt7.51□□□□□ -1.21
SSN8P47821 YMR253CYMR253C 1245 nt7.51□□□□□ -1.21
SSN8P47821 CCT5YJR064W 1689 nt7.51□□□□□ -1.21
SSN8P47821 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.5□□□□□ -1.21
SSN8P47821 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.5□□□□□ -1.21
SSN8P47821 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.5□□□□□ -1.21
SSN8P47821 ADE8YDR408C 645 nt7.5□□□□□ -1.21
SSN8P47821 FUN14YAL008W 597 nt7.5□□□□□ -1.21
SSN8P47821 SNZ1YMR096W 894 nt7.5□□□□□ -1.21
SSN8P47821 YPR126CYPR126C 309 nt7.5□□□□□ -1.21
SSN8P47821 CMK2YOL016C 1344 nt7.5□□□□□ -1.21
SSN8P47821 SAC7YDR389W 1965 nt7.5□□□□□ -1.21
SSN8P47821 ERG6YML008C 1152 nt7.49□□□□□ -1.21
SSN8P47821 ADH6YMR318C 1083 nt7.49□□□□□ -1.21
SSN8P47821 VMA11YPL234C 495 nt7.49□□□□□ -1.21
SSN8P47821 YDR306CYDR306C 1437 nt7.49□□□□□ -1.21
SSN8P47821 YCR061WYCR061W 1896 nt7.49□□□□□ -1.21
SSN8P47821 ERR3YMR323W 1314 nt7.49□□□□□ -1.21
SSN8P47821 ERR1YOR393W 1314 nt7.49□□□□□ -1.21
SSN8P47821 ERR2YPL281C 1314 nt7.49□□□□□ -1.21
SSN8P47821 YJR114WYJR114W 393 nt7.48□□□□□ -1.21
SSN8P47821 TIP1YBR067C 633 nt7.48□□□□□ -1.21
SSN8P47821 FCP1YMR277W 2199 nt7.47□□□□□ -1.21
SSN8P47821 SPE4YLR146C 903 nt7.47□□□□□ -1.21
SSN8P47821 YLR072WYLR072W 2082 nt7.47□□□□□ -1.21
SSN8P47821 YJL045WYJL045W 1905 nt7.46□□□□□ -1.21
SSN8P47821 YEL008WYEL008W 381 nt7.46□□□□□ -1.22
SSN8P47821 MDH2YOL126C 1134 nt7.46□□□□□ -1.22
SSN8P47821 HEL1YKR017C 1656 nt7.46□□□□□ -1.22
SSN8P47821 LEU4YNL104C 1860 nt7.46□□□□□ -1.22
SSN8P47821 YNR064CYNR064C 873 nt7.45□□□□□ -1.22
SSN8P47821 IML3YBR107C 738 nt7.45□□□□□ -1.22
SSN8P47821 YER152CYER152C 1332 nt7.45□□□□□ -1.22
SSN8P47821 AQR1YNL065W 1761 nt7.44□□□□□ -1.22
SSN8P47821 YFR036W-AYFR036W-A 651 nt7.44□□□□□ -1.22
SSN8P47821 CKI1YLR133W 1749 nt7.43□□□□□ -1.22
SSN8P47821 HXT11YOL156W 1704 nt7.43□□□□□ -1.22
SSN8P47821 SMC5YOL034W 3282 nt7.42□□□□□ -1.22
SSN8P47821 TVP23YDR084C 600 nt7.42□□□□□ -1.22
SSN8P47821 SPS100YHR139C 981 nt7.42□□□□□ -1.22
SSN8P47821 ELO1YJL196C 933 nt7.42□□□□□ -1.22
SSN8P47821 OPI3YJR073C 621 nt7.42□□□□□ -1.22
SSN8P47821 SNX3YOR357C 489 nt7.42□□□□□ -1.22
SSN8P47821 NPP2YEL016C 1482 nt7.42□□□□□ -1.22
SSN8P47821 CTI6YPL181W 1521 nt7.42□□□□□ -1.22
SSN8P47821 Q0010Q0010 387 nt7.41□□□□□ -1.22
SSN8P47821 YBL111CYBL111C 2004 nt7.4□□□□□ -1.22
SSN8P47821 TAF13YML098W 504 nt7.4□□□□□ -1.22
SSN8P47821 MHF1YOL086W-A 273 nt7.4□□□□□ -1.22
SSN8P47821 YMR265CYMR265C 1386 nt7.4□□□□□ -1.22
SSN8P47821 TRP2YER090W 1524 nt7.4□□□□□ -1.22
SSN8P47821 KEL3YPL263C 1956 nt7.4□□□□□ -1.23
SSN8P47821 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.39□□□□□ -1.23
SSN8P47821 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.39□□□□□ -1.23
SSN8P47821 DIA4YHR011W 1341 nt7.38□□□□□ -1.23
SSN8P47821 RPN14YGL004C 1254 nt7.38□□□□□ -1.23
SSN8P47821 HAP5YOR358W 729 nt7.38□□□□□ -1.23
SSN8P47821 PMT7YDR307W 1989 nt7.38□□□□□ -1.23
SSN8P47821 SAM50YNL026W 1455 nt7.37□□□□□ -1.23
SSN8P47821 SRM1YGL097W 1449 nt7.37□□□□□ -1.23
SSN8P47821 FTH1YBR207W 1398 nt7.37□□□□□ -1.23
SSN8P47821 STE4YOR212W 1272 nt7.37□□□□□ -1.23
SSN8P47821 ABZ2YMR289W 1125 nt7.36□□□□□ -1.23
SSN8P47821 snR31snR31 225 nt7.35□□□□□ -1.23
SSN8P47821 SUV3YPL029W 2214 nt7.35□□□□□ -1.23
SSN8P47821 POT1YIL160C 1254 nt7.34□□□□□ -1.23
SSN8P47821 TOS2YGR221C 1869 nt7.33□□□□□ -1.24
SSN8P47821 YPL264CYPL264C 1062 nt7.33□□□□□ -1.24
SSN8P47821 AMF1YOR378W 1548 nt7.32□□□□□ -1.24
SSN8P47821 ENO2YHR174W 1314 nt7.32□□□□□ -1.24
SSN8P47821 EDC3YEL015W 1656 nt7.32□□□□□ -1.24
SSN8P47821 POB3YML069W 1659 nt7.32□□□□□ -1.24
SSN8P47821 YLR349WYLR349W 507 nt7.32□□□□□ -1.24
SSN8P47821 SWT21YNL187W 1074 nt7.32□□□□□ -1.24
SSN8P47821 PUS7YOR243C 2031 nt7.32□□□□□ -1.24
SSN8P47821 YDR467CYDR467C 327 nt7.31□□□□□ -1.24
SSN8P47821 CPD1YGR247W 720 nt7.31□□□□□ -1.24
SSN8P47821 ACO1YLR304C 2337 nt7.3□□□□□ -1.24
SSN8P47821 CRC1YOR100C 984 nt7.3□□□□□ -1.24
SSN8P47821 YJR154WYJR154W 1041 nt7.29□□□□□ -1.24
SSN8P47821 CRN1YLR429W 1956 nt7.29□□□□□ -1.24
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