Protein–RNA interactions for Protein: P40048

PTP3, Tyrosine-protein phosphatase 3, yeastyeast

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PTP3P40048 PEX22YAL055W 543 nt12.41□□□□□ -0.42
PTP3P40048 DSC2YOL073C 969 nt12.41□□□□□ -0.42
PTP3P40048 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt12.4□□□□□ -0.42
PTP3P40048 RRS1YOR294W 612 nt12.4□□□□□ -0.42
PTP3P40048 HSP60YLR259C 1719 nt12.4□□□□□ -0.43
PTP3P40048 YHR145CYHR145C 357 nt12.39□□□□□ -0.43
PTP3P40048 SWE1YJL187C 2460 nt12.39□□□□□ -0.43
PTP3P40048 PLB1YMR008C 1995 nt12.39□□□□□ -0.43
PTP3P40048 COS6YGR295C 1146 nt12.38□□□□□ -0.43
PTP3P40048 RAD17YOR368W 1206 nt12.38□□□□□ -0.43
PTP3P40048 TGS1YPL157W 948 nt12.38□□□□□ -0.43
PTP3P40048 HMRA1YCR097W 381 nt12.37□□□□□ -0.43
PTP3P40048 RPF2YKR081C 1035 nt12.37□□□□□ -0.43
PTP3P40048 SAM50YNL026W 1455 nt12.35□□□□□ -0.43
PTP3P40048 YCP4YCR004C 744 nt12.35□□□□□ -0.43
PTP3P40048 CBS1YDL069C 690 nt12.35□□□□□ -0.43
PTP3P40048 KRE28YDR532C 1158 nt12.35□□□□□ -0.43
PTP3P40048 PTC7YHR076W 1032 nt12.35□□□□□ -0.43
PTP3P40048 ISA2YPR067W 558 nt12.35□□□□□ -0.43
PTP3P40048 YIL092WYIL092W 1902 nt12.35□□□□□ -0.43
PTP3P40048 YLR198CYLR198C 360 nt12.33□□□□□ -0.44
PTP3P40048 YDR306CYDR306C 1437 nt12.32□□□□□ -0.44
PTP3P40048 FSH1YHR049W 732 nt12.32□□□□□ -0.44
PTP3P40048 YKR104WYKR104W 921 nt12.32□□□□□ -0.44
PTP3P40048 YIF1YNL263C 945 nt12.32□□□□□ -0.44
PTP3P40048 KRE1YNL322C 942 nt12.32□□□□□ -0.44
PTP3P40048 PUS7YOR243C 2031 nt12.3□□□□□ -0.44
PTP3P40048 YER190C-AYER190C-A 576 nt12.3□□□□□ -0.44
PTP3P40048 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt12.3□□□□□ -0.44
PTP3P40048 YHR022CYHR022C 771 nt12.3□□□□□ -0.44
PTP3P40048 YML133W-AYML133W-A 576 nt12.3□□□□□ -0.44
PTP3P40048 MRPL24YMR193W 777 nt12.3□□□□□ -0.44
PTP3P40048 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt12.3□□□□□ -0.44
PTP3P40048 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt12.3□□□□□ -0.44
PTP3P40048 RRP15YPR143W 753 nt12.3□□□□□ -0.44
PTP3P40048 SNZ1YMR096W 894 nt12.29□□□□□ -0.44
PTP3P40048 LIP1YMR298W 453 nt12.29□□□□□ -0.44
PTP3P40048 MER1YNL210W 813 nt12.29□□□□□ -0.44
PTP3P40048 GAL3YDR009W 1563 nt12.28□□□□□ -0.44
PTP3P40048 YEA4YEL004W 1029 nt12.28□□□□□ -0.44
PTP3P40048 GSF2YML048W 1212 nt12.28□□□□□ -0.44
PTP3P40048 ELO1YJL196C 933 nt12.27□□□□□ -0.45
PTP3P40048 APS2YJR058C 444 nt12.27□□□□□ -0.45
PTP3P40048 LSB5YCL034W 1065 nt12.27□□□□□ -0.45
PTP3P40048 UTR1YJR049C 1593 nt12.26□□□□□ -0.45
PTP3P40048 MHO1YJR008W 1017 nt12.26□□□□□ -0.45
PTP3P40048 VPS20YMR077C 666 nt12.26□□□□□ -0.45
PTP3P40048 RTN2YDL204W 1182 nt12.25□□□□□ -0.45
PTP3P40048 POT1YIL160C 1254 nt12.25□□□□□ -0.45
PTP3P40048 SPC24YMR117C 642 nt12.25□□□□□ -0.45
PTP3P40048 CSM1YCR086W 573 nt12.24□□□□□ -0.45
PTP3P40048 RRP17YDR412W 708 nt12.24□□□□□ -0.45
PTP3P40048 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt12.24□□□□□ -0.45
PTP3P40048 YAP7YOL028C 738 nt12.24□□□□□ -0.45
PTP3P40048 OCA4YCR095C 1089 nt12.23□□□□□ -0.45
PTP3P40048 FES1YBR101C 873 nt12.23□□□□□ -0.45
PTP3P40048 YKR015CYKR015C 1707 nt12.23□□□□□ -0.45
PTP3P40048 SPR1YOR190W 1338 nt12.22□□□□□ -0.45
PTP3P40048 ISR1YPR106W 1332 nt12.22□□□□□ -0.45
PTP3P40048 BSP1YPR171W 1731 nt12.21□□□□□ -0.45
PTP3P40048 SED1YDR077W 1017 nt12.21□□□□□ -0.45
PTP3P40048 OMA1YKR087C 1038 nt12.21□□□□□ -0.45
PTP3P40048 BTT1YDR252W 450 nt12.2□□□□□ -0.46
PTP3P40048 TRP4YDR354W 1143 nt12.2□□□□□ -0.46
PTP3P40048 REX3YLR107W 1215 nt12.2□□□□□ -0.46
PTP3P40048 YNL228WYNL228W 777 nt12.2□□□□□ -0.46
PTP3P40048 MHF1YOL086W-A 273 nt12.2□□□□□ -0.46
PTP3P40048 MGR3YMR115W 1506 nt12.2□□□□□ -0.46
PTP3P40048 DBR1YKL149C 1218 nt12.19□□□□□ -0.46
PTP3P40048 TFB4YPR056W 1017 nt12.18□□□□□ -0.46
PTP3P40048 ERV41YML067C 1059 nt12.17□□□□□ -0.46
PTP3P40048 RRP40YOL142W 723 nt12.17□□□□□ -0.46
PTP3P40048 CHA1YCL064C 1083 nt12.16□□□□□ -0.46
PTP3P40048 ATG29YPL166W 642 nt12.16□□□□□ -0.46
PTP3P40048 RIB7YBR153W 735 nt12.15□□□□□ -0.46
PTP3P40048 RMD5YDR255C 1266 nt12.14□□□□□ -0.47
PTP3P40048 HIF1YLL022C 1158 nt12.14□□□□□ -0.47
PTP3P40048 YET2YMR040W 483 nt12.14□□□□□ -0.47
PTP3P40048 BTS1YPL069C 1008 nt12.14□□□□□ -0.47
PTP3P40048 YCR025CYCR025C 411 nt12.13□□□□□ -0.47
PTP3P40048 ENT5YDR153C 1236 nt12.13□□□□□ -0.47
PTP3P40048 IGD1YFR017C 588 nt12.13□□□□□ -0.47
PTP3P40048 CSL4YNL232W 879 nt12.13□□□□□ -0.47
PTP3P40048 ARR1YPR199C 885 nt12.13□□□□□ -0.47
PTP3P40048 RPT5YOR117W 1305 nt12.12□□□□□ -0.47
PTP3P40048 CTI6YPL181W 1521 nt12.12□□□□□ -0.47
PTP3P40048 ACO2YJL200C 2370 nt12.12□□□□□ -0.47
PTP3P40048 NIF3YGL221C 867 nt12.12□□□□□ -0.47
PTP3P40048 TAF11YML015C 1041 nt12.12□□□□□ -0.47
PTP3P40048 GFD1YMR255W 567 nt12.12□□□□□ -0.47
PTP3P40048 IZH4YOL101C 939 nt12.12□□□□□ -0.47
PTP3P40048 SHE9YDR393W 1371 nt12.12□□□□□ -0.47
PTP3P40048 MEP3YPR138C 1470 nt12.12□□□□□ -0.47
PTP3P40048 YMR103CYMR103C 363 nt12.11□□□□□ -0.47
PTP3P40048 YOL079WYOL079W 399 nt12.11□□□□□ -0.47
PTP3P40048 SLM4YBR077C 489 nt12.11□□□□□ -0.47
PTP3P40048 YPL277CYPL277C 1464 nt12.1□□□□□ -0.47
PTP3P40048 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt12.1□□□□□ -0.47
PTP3P40048 YPL251WYPL251W 303 nt12.1□□□□□ -0.47
PTP3P40048 YPR126CYPR126C 309 nt12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 69.1 ms