Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABRA5P31644 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABRA5P31644 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA5P31644 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA5P31644 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA5P31644 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA5P31644 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA5P31644 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABRA5P31644 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRA5P31644 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRA5P31644 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRA5P31644 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABRA5P31644 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRA5P31644 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABRA5P31644 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRA5P31644 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABRA5P31644 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRA5P31644 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRA5P31644 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRA5P31644 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABRA5P31644 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABRA5P31644 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GABRA5P31644 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GABRA5P31644 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GABRA5P31644 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms