Protein–RNA interactions for Protein: P26998

CRYBB3, Beta-crystallin B3, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRYBB3P26998 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
CRYBB3P26998 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CRYBB3P26998 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CRYBB3P26998 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CRYBB3P26998 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms